Церковь Иоанна Златоуста, как и Ильинская, была построена в середине XVII в. Но если Ильинская была и осталась уникальной благодаря своему асимметричному плану, то церковь Иоанна как раз, наоборот, положила начало целой школе церковной архитектуры, основанной на полной симметрии как в общей планировке, так и в плане всех объемов. Для нее характерна также большая высота куполов, которые вместе с барабанами (цилиндрическими башнями), на которых они стоят, и крестами намного превосходят высоту основного куба. Роспись стен и сводов произведена замечательным ярославским художником XVIII в. Алексеем Ивановым и его подручными в 1732-1733 гг.