Изначально - в 1894 году - церковь Преображения Господня была построена на территории Епархиального свечного завода. В советское время на месте свечного завода открыли военный госпиталь, храм был лишен центрального купола и звонницы. Его помещение использовали под клуб и вернули Церкви в аварийном состоянии.
Сейчас возвращенные здания постепенно восстанавливаются, проведен ремонт основного корпуса, и в нем уже расположились регентское отделение и иконописный класс Ставропольской Духовной Семинарии.