Один за другим в XVIII веке возводились огромные, изукрашенные кирпичной «резьбой» сооружения, заменявшие деревянные храмы. Первым каменным храмом Приенисейского края стал Богоявленский собор. По-прежнему царит над городом огромный, квадратный в основании, восьмигранный столп колокольни Богоявленского собора, когда-то главного собора Енисейска, построенного в 1712 году, присланным из Тобольска зодчим Федотом Чайкой. Колокол для церкви привезли в 1903 году из Центральной России, и тысячная толпа енисейцев на веревках затаскивала его на колокольню через специально оставленный проем.
Любопытно, что мастер из Тобольска приехал в Енисейск с целью строить каменный гостиный двор. Приездом опытного зодчего немедленно воспользовалось енисейско духовенство, по инициативе которого прихожане Введенской церкви обратились в Тобольск за разрешением выстроить на «соборные мирские деньги» каменный Богоявленский собор. Артель Чайки выстроила русскую трапезную церковь на подклете с продольно-осевой композиционной структурой построения. Самыми распространенными в сибирском зодчестве XVIII века были храмы типа «восьмерик на четверике» - восьмигранник на четырехугольнике. С востока на запад на территории собора располагались: сам восьмигранный храм, трапезная с приделом и высокая ярусная колокольня. Храм завершался вспученной с заломом у основания кровлей и увенчивался главкой на барабане. Архитектура этого здания нашла отражение в композициях Воскресенской церкви и Спасского собора Енисейского мужского монастыря.
Пожаром была уничтожена первая каменная церковь Енисейска. С южной стороны сгоревшего собора «во имя введения во храм пресвятой Богородицы» заложен теплый храм, в 1740 году пристроен теплый придел, главный храм второго Богоявленского собора построен под руководством московских дворян Семена и Епифана Надеиных около 1750 года.
При возведении новых церквей енисейские зодчие следовали принципу панорамного построения композиции главных доминант города, благодаря чему мы имеем возможность любоваться с водной глади Енисея на четыре величавых каменных городских храма - Преображенская, Воскресенская, Христорождественская церкви и Богоявленский собор, поставленные в один ряд вдоль енисейского берега.
Храм нуждается в реставрации.