22 июля 1761 года Тобольским митрополитом Павлом был освящен и подписан на голубом атласе антиминс для престола храма во имя Преображения Господня.
То ли по причине волнений приписных крестьян, то ли по великой скудости крестьянской строительство храма отодвинулось.
В 1765 году 27 июня по грамоте того же митрополита Павла в с. Батурино была заложена деревянная церковь. Строителем храма и первым устроителем Батуринского прихода стал Василий Тимофеевич Капустин (1732-1808 г.г.) основатель священнического рода Капустиных.
В конце 1793 г. настоятелем стал о.Леонтий (Леонтий Васильевич Капустин) сын о.Василия.
В 1765 г. к церкви Преображения Господня пристроили придел во имя Божией Матери Казанской. Антиминс для престола этого храма освящен и подписан 4 июля 1794 г. архиепископом Тобольским Варлаамом. Придел освящен 29 ноября 1794 г.
В 1801 г. вышел указ о строительстве каменной церкви.
1 июня 1816 г. о.Леонтий заложил новую каменную церковь с колокольней. Строилась церковь "тщанием прихожан и доброхотных дателей" уже сыном о.Леонтия Иоанном, который заступил на место отца в 1818 году.
22 октября 1819 г. был освящен престол в нижнем теплом храме во имя Казанской Божией Матери и верхнем холодном - Преображения Господа нашего Иисуса Христа.
Деятельность о.Леонтия, как благочинного иерея была отмечена многими наградами.
В 1835 году церковь была закончена. В недострое оставались штукатурные и деревянные работы.
В 1856 году настоятелем становится сын о.Иоанна Николай.
К 100-летию непрерывного священствования рода Капустиных братом о.Иоанна эпископом Ионой ( Екатеринбургским ) Преображенскому храму был подарен колокол весом 250 пудов.
В 1865 году о.Антонин ( Андрей Иванович Капустин ) пожертвовал Батуринскому храму топазовый, в серебряной оправе напрестольный крест, украшенный разными драгоценными камнями. У подножия распятия вложена частица Животворящего древа креста.
В 1865 году смерть постигла о.Иоанна и сына его о.Николая. Служить стал о.Александр ( Александр Иванович Капустин ). На нем и закончилась более чем столетняя священническая линия Капустиных в с.Батурино.
С 1868 по 1871 г.г. настоятелем был о.Сергий ( Сергей Григорьевич Троицкий).
С 1871 по 1883 г.г. о.Николай ( Николай Иванович Щапков ).
С 1883 по 1905 г.г. о.Дмитрий ( Дмитрий Иванович Носиков ).
С 1905 по 1906 г.г. о.Василий ( Василий Дмитриевич Батурин ).
С 1906 по 1918 г.г. о.Варсанофий ( Варсанофий Стефанович Пономарев ).
С 1918 по 1929 г.г. о.Симеон ( Симеон Иванович Пальмов).
В 1922 г. из Батуринской церкви ( По декрету ВЦИК ) были изъяты богослужебные предметы в количестве 142 штуки включая топазовый напрестольный крест в серебряной оправе с дарственной надписью. 15 апреля 1931 года президиум Батуринского поселкового совета постановил : церковь изъять и использовать для культурных целей. В советский период храм использовался попеременно под банк, дизельную станцию, которая находилась в алтаре придела Казанской Божией Матери, типографию, училище, машинно-тракторную станцию, а во время войны колокольня стала парашутной вышкой.
Перед началом войны молния ударила в крест на колокольне, после чего долгое время горел деревянный шпиль, предвещая большую беду.
В 1995 г. храм был передан верующим для восстановления Батуринским с/советом. Здание находилось в плачевном состоянии. Все, что не смогли украсть, то сожгли ( лестницу в верхний придел, полы в приделе Преображения Господня. Проломили проем для въезда тракторов ).
Усилиями в основном верующих женщин к 1999 г. Предел Казанской Божией Матери был приведен в относительный порядок.
29 июня 1999 г. Преосвященный Михаил, епископ Курганский и Шадринский, издал указ о первом священнике для храма.
19 августа 1999 г. состоялась первая служба. Ее провел иеромонах Ексокустодиян ( Норов Игорь Борисович ).
1 июля 2001 г. Указом по епархии в храм настоятелем был назначен о.Сергий ( Сергей Львович Кривых ), который служит и поныне.
Начинать пришлось с нуля: на окнах пленка, нет крыши на главном куполе и между куполом и колокольней, и элементарных условий жизни священника и его семьи.
За эти годы храм постепенно восстанавливается. Службы начали проходить в тепле, восстановлены лестницы в верхний придел и на колокольню, заделаны проломы и восстановлен шпиль и крест на колокольне.
В настоящее время начаты работы по восстановлению придела Преображения Господня.
Святыни храма:
Частицы мощей преподобномучениц Елизаветы и Варвары.
Частицы были благословлены в 2007 году игуменьей Горненского монастыря в Иерусалиме Елисаветой.